Видимо, вы пытаетесь изменять данные в базе данных через объект типа СправочникСсылка.
Объекты данного типа позволяют обращаться к реквизитам и табличным частям в режиме Только чтение.
Чтобы изменить данные в базе данных, нужно получить специальный объект для записи - СправочникОбъект. Это возможно с помощью метода ПолучитьОбъект().
Именно через объект типа СправочникОбъект (а также ДокументОбъект, ПланСчетовОбъект и аналогичные) возможно изменение данных в базе данных.
Подробнее о взаимосвязи объектов можно прочитать на ИТС в разделах Работа с прикладными объектами средствами встроенного языка, Типы значений, связанные с прикладными объектами.